在PyCharm中运行MySQL，需要安装相应的驱动和配置数据库连接。下面是一些步骤来帮助你完成这个过程：

第一步：安装MySQL数据库驱动

首先，你需要安装Python的MySQL数据库驱动程序。这里推荐使用`pymsql`驱动，它是一个纯Python编写的MySQL驱动程序。你可以使用以下命令在命令行中安装：

pip install pymysql

第二步：设置数据库连接

在PyCharm中，你需要设置数据库连接。打开PyCharm并创建一个新的Python项目。在项目中创建一个Python文件，然后在文件中添加以下代码来设置数据库连接：

```python

import pymysql

# 连接数据库

db = pymysql.connect(

host='localhost', # 数据库主机地址

port=3306, # 数据库端口号，默认为3306

user='root', # 数据库用户名

password='123456', # 数据库密码

database='test' # 数据库名

)

# 创建游标对象

cursor = db.cursor()

# 执行SQL查询

cursor.execute("SELECT VERSION()")

# 获取单条数据

data = cursor.fetchone()

print("Database version : %s " % data)

# 关闭数据库连接

db.close()

在上面的代码中，我们首先使用`pymysql.connect()`方法来建立与MySQL数据库的连接。你需要提供数据库主机地址、端口号、用户名、密码和数据库名。请根据你自己的数据库设置进行修改。接下来，我们创建一个游标对象，使用该对象来执行SQL查询。我们将使用`cursor.execute()`方法来执行`SELECT VERSION()`查询，并使用`cursor.fetchone()`方法来获取查询结果。最后，我们关闭数据库连接。

第三步：运行程序

保存文件后，你可以在PyCharm中点击运行按钮来运行程序。如果一切设置正确，你应该可以看到控制台输出数据库的版本信息。

通过上述步骤，你已经成功在PyCharm中运行了MySQL数据库。你可以根据自己的需求修改代码，执行其他数据库操作。