1. MySQL的Slow Query Log：MySQL的Slow Query Log可以记录执行时间超过指定时间的SQL语句，可以通过查看这些日志来检查连接时间是否超时。设置方法如下：

首先，在MySQL的配置文件my.cnf中加入以下语句开启Slow Query Log：

slow_query_log = 1

slow_query_log_file = /var/log/mysql/mysql-slow.log

long_query_time = 2

其中，slow_query_log表示开启Slow Query Log，slow_query_log_file表示日志文件的存放路径，long_query_time表示执行时间超过多少秒的SQL语句会被记录。在这个例子中，就表示执行时间超过2秒的SQL语句会被记录在日志文件中。

然后，重启MySQL服务，即可开始记录Slow Query Log。可以通过tail命令查看日志文件：

tail -f /var/log/mysql/mysql-slow.log

2. MySQL的General Log：MySQL的General Log可以记录所有的SQL语句及其执行时间，但是因为记录的内容比较多，所以相对于Slow Query Log来说，占用的空间和时间都要更多。可以通过以下语句开启General Log：

general_log = 1

general_log_file = /var/log/mysql/mysql.log

其中，general_log表示开启General Log，general_log_file表示日志文件的存放路径。同样的，重启MySQL服务后，即可开始记录General Log。

3. 使用MySQL的Performance Schema：MySQL的Performance Schema可以获取许多关于数据库性能的详细信息，包括SQL语句的执行时间。可以通过以下语句开启Performance Schema：

performance_schema = 1

然后，使用如下语句查询连接时间：

SELECT * FROM performance_schema.events_statements_summary_by_digest WHERE digest_text LIKE '%connect%';

其中，performance_schema.events_statements_summary_by_digest是连接时间的统计表，digest_text表示SQL语句的摘要，使用LIKE模糊查询可以查询包含connect关键字的SQL语句，即连接语句。查询结果包括每个连接的执行时间、执行次数、平均执行时间等信息。

总的来说，通过日志和Performance Schema的方式可以更全面地了解MySQL的连接时间，而具体使用哪种方式，需要根据实际情况和需求进行选择。