PHP留言与回复可以通过以下步骤实现：

1. 创建数据库

首先，需要创建一个数据库来存储留言和回复信息。可以使用MySQL或其他关系型数据库来创建一个表，包括留言和回复的字段，例如：留言ID、留言内容、留言时间、回复ID、回复内容、回复时间等。

2. 编写PHP页面

创建一个PHP页面来获取用户输入的留言信息和回复信息，并将它们存储到数据库中。可以使用一个HTML表单来获取用户输入的留言文本和回复文本，然后将它们传递给PHP页面进行处理。

3. 显示留言

创建另一个PHP页面来显示所有留言。这个页面会从数据库中检索所有留言信息并将它们显示在网页上。可以使用循环来遍历每个留言，并显示它们的ID、内容和时间。

4. 回复留言

实现回复留言功能的方式可以有很多种，但通常是在显示留言页面上添加一个“回复”按钮或链接，当用户点击它时，会显示一个回复表单。可以使用JavaScript来实现这个功能，同时将回复信息保存到数据库中。

5. 显示回复

当用户回复一条留言时，需要将回复信息与留言关联起来，并在显示留言页面上对它们进行排序，以便用户能够看到与每条留言相关的所有回复。在显示留言和回复时，可以使用递归方法来处理嵌套回复。

6. 添加安全验证

最后一步是在PHP页面中添加安全验证，以确保用户输入的数据不会被恶意攻击者利用。可以使用htmlspecialchars()函数来转义特殊字符，以避免SQL注入攻击和跨站脚本攻击。

总之，PHP留言与回复需要一定的数据库和PHP编程知识，需要进行详细的设计和实现。

要实现留言与回复功能，可以参考以下步骤：

1. 创建数据库表

首先，需要创建两个数据库表，一个用于存储留言信息，另一个用于存储留言的回复信息。可以创建两个表格，例如“messageboard”和“messageboard_reply”。结构如下：

CREATE TABLE `messageboard` (

`id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,

`name` varchar(255) NOT NULL,

`email` varchar(255) NOT NULL,

`message` text NOT NULL,

`create_time` datetime NOT NULL

)

CREATE TABLE `messageboard_reply` (

`id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,

`message_id` int(11) NOT NULL,

`name` varchar(255) NOT NULL,

`email` varchar(255) NOT NULL,

`reply` text NOT NULL,

`create_time` datetime NOT NULL

)

2. 创建留言提交页面

创建一个留言提交页面，包含一个表单，收集用户的姓名、邮箱和留言内容。提交表单时，将这些信息插入到“messageboard”表中。

3. 显示留言列表

创建一个页面，显示所有留言信息。从“messageboard”表中读取数据，并显示在页面上。同时，为了方便用户回复留言，为每条留言添加“回复”按钮。

4. 创建回复提交页面

当用户点击某条留言的“回复”按钮时，跳转到一个回复提交页面。这个页面应该包含一个表单，收集用户的姓名、邮箱和回复内容，并将这些信息插入到“messageboard_reply”表中。

5. 显示回复内容

返回留言列表页面时，可以在每条留言下方显示回复内容。从“messageboard_reply”表中读取数据，并将回复内容显示在相应的留言下方。

以上就是php留言与回复的基本实现步骤。需要注意的是，为了安全起见，我们需要加入输入验证和防止SQL注入等安全措施。