1. 确定哪个表的主键重复：首先需要确定哪个表的主键出现了重复。在MySQL中，可以使用以下查询语句进行查找：

```

SELECT * FROM table_name WHERE primary_key=value;

```

其中，table_name是表的名称，primary_key是主键的名称，value是重复的主键值。

2. 找到所有重复的主键：使用以上查询语句，可以获取所有与重复主键值匹配的行，从而找到所有重复的主键。记录下所有重复主键的ID值。

3. 修改重复主键的值：使用以下UPDATE语句，将所有重复主键的值进行修改：

```

UPDATE table_name SET primary_key=new_value WHERE id=##;

```

其中，table_name是表的名称，primary_key是主键的名称，new_value是你想要修改的新值，id是重复主键的ID值。

4. 确认修改是否成功：使用以下查询语句，再次确认修改已经成功：

```

SELECT * FROM table_name WHERE primary_key=new_value;

```

其中，table_name是表的名称，primary_key是主键的名称，new_value是你修改后的新值。

如果出现了多个重复的主键，需要重复以上步骤，分别修改每个重复主键的值，直到所有的主键都不再重复为止。