MySQL是一个常用的关系型数据库管理系统，它允许用户存储和操作大量的数据。在使用MySQL过程中，由于数据的插入、更新和删除操作，数据库中会产生碎片（fragmentation）。碎片是指数据库表中的数据或索引在物理存储上不连续的情况，这会占用额外的空间并影响数据库的性能。

为了清除MySQL中的碎片，可以采取以下多种方法：

1. 重新组织表格（REORGANIZE TABLE）

使用REORGANIZE TABLE命令可以重新组织表格，从而消除碎片。这个命令将重新建立表格，并使数据再次按照主键顺序进行存储。具体语法如下：

```

REORGANIZE TABLE table_name;

```

请注意，REORGANIZE TABLE命令只能用于InnoDB存储引擎。

2. 优化表格（OPTIMIZE TABLE）

通过使用OPTIMIZE TABLE命令，可以对表格进行优化，包括重新组织表格以消除碎片。与REORGANIZE TABLE不同的是，OPTIMIZE TABLE还会重新建立索引以提高数据库的性能。具体语法如下：

```

OPTIMIZE TABLE table_name;

```

OPTIMIZE TABLE命令适用于MyISAM和InnoDB存储引擎。

3. 重建索引（REBUILD INDEX）

通过重建索引，可以清除碎片并提高数据库的性能。具体可通过删除并创建索引来实现。需要注意的是，该方法可能会导致数据库表的锁定时间较长，因此在高负载情况下需要谨慎使用。具体语法如下：

```

ALTER TABLE table_name DROP INDEX index_name;

ALTER TABLE table_name ADD INDEX index_name (column_name);

```

对于大型数据库和高负载系统，可考虑使用在线重建索引工具，如pt-online-schema-change。

4. 清除日志（PURGE BINARY/MASTER LOGS）

除了清除数据库中的碎片，还可以通过清除二进制日志或主日志来释放空间。具体语法如下：

```

PURGE BINARY LOGS BEFORE 'yyyy-mm-dd hh:mm:ss';

```

或者使用以下命令清除主日志：

```

PURGE MASTER LOGS BEFORE 'yyyy-mm-dd hh:mm:ss';

```

注意，清除日志可能会导致数据丢失，因此在操作之前一定要先备份数据库。

以上是几种常见的清除MySQL碎片的方法，根据实际情况选择合适的方法进行操作。在执行任何操作之前，请务必备份数据库以防止数据丢失。