清理MySQL数据库是确保数据库性能和可用性的重要任务之一。以下是一些常见的方法来清理MySQL数据库：

1. 删除不再需要的数据：首先，检查数据库中是否有不再需要的数据，比如旧的日志文件、过期的备份文件等。可以使用DELETE或者TRUNCATE命令删除表中的数据，或者使用DROP TABLE命令删除整个表。

2. 优化表结构：通过分析表的使用情况，可以优化表的结构以提高查询性能。可以使用ALTER TABLE命令修改表的数据类型、增加或删除索引等。

3. 清理日志文件：MySQL会生成各种日志文件，如错误日志、二进制日志、慢查询日志等。定期检查这些日志文件，并删除不再需要的日志文件，以释放磁盘空间。

4. 优化查询语句：优化查询语句可以提高查询性能。可以使用EXPLAIN命令分析查询语句的执行计划，找出问题并进行优化。

5. 清理缓存：MySQL会使用各种缓存来提高性能，如查询缓存、InnoDB缓冲池等。定期清理缓存可以释放内存空间并提高性能。

6. 定期备份：定期备份数据库可以防止数据丢失和数据损坏。可以使用MySQL的备份工具或第三方工具来执行备份操作。

7. 数据库之间的迁移：如果有多个数据库服务器，可以将一些数据库移动到其他服务器上，以均衡服务器负载。

8. 更新数据库软件：定期更新MySQL数据库软件可以保持系统安全，并获得新的功能和性能优化。

综上所述，定期清理MySQL数据库是确保数据库性能和可用性的重要任务。通过删除不需要的数据、优化表结构、清理日志文件、优化查询语句、清理缓存、定期备份、数据库迁移和更新数据库软件等方法，可以保持数据库的良好状态。