在MySQL中，有多种不同的存储引擎可供选择，每种引擎都有其自身的优势和适用场景。在选择存储引擎时，需要考虑以下几个因素：

1. 数据类型和功能：不同存储引擎对数据类型和支持的功能有不同的限制。InnoDB和MyISAM是MySQL中最常用的两种存储引擎。InnoDB支持事务、外键和行级锁定，适用于处理大量的插入和更新操作。而MyISAM则适用于大量的查询和读操作，不支持事务和行级锁定。

2. 并发性能：如果你的应用程序需要同时处理大量的并发读写操作，那么InnoDB引擎是一个较好的选择，因为它支持行级锁定，在高并发环境下具有较好的性能。而对于少量的并发操作和大量的查询操作，MyISAM引擎则更适合。

3. 数据完整性：如果你对数据完整性要求较高，例如需要支持事务和外键约束，那么InnoDB引擎是首选。InnoDB引擎通过使用事务来确保数据的一致性和完整性。而MyISAM引擎没有事务支持，所以在数据完整性方面相对较弱。

4. 存储空间和性能：MyISAM引擎在存储空间利用方面相对较好，因为它使用表级锁定，不支持行级锁定和事务。而InnoDB引擎在存储空间利用方面相对较差，因为它需要额外的空间来存储和管理事务和行级锁定信息。

5. 备份和恢复：MyISAM引擎支持热备份，可以在数据文件操作时继续执行读操作，但需要对表进行锁定。而InnoDB引擎在备份数据时需要对表进行锁定，可能会影响读写操作的执行。

综上所述，选择合适的存储引擎需要根据具体的业务需求和性能要求来进行权衡。对于大部分应用来说，InnoDB引擎是一个比较理想的选择，因为它具有较好的数据完整性、并发性能和事务支持。但如果应用程序主要是进行查询和读操作，并且对数据完整性要求不高，那么MyISAM引擎也是一个可行的选项。此外，MySQL还有其他一些存储引擎可供选择，如Memory、Archive、CSV等，根据具体需求进行评估和选择。